يكون للمركز مدير يعين بقرار من المجلس، ويحدد القرار أجره ومزاياه المالية الأخرى، ويكون المسؤول التنفيذي عن إدارة المركز، وتتركز مسؤولياته في حدود ما ينص عليه التنظيم، وما يقرره المجلس، وله بوجه خاص مباشرة الاختصاصات الآتية:
- اقتراح هيكل المركز التنظيمي، ولوائحه المالية والإدارية، وعرضها على المجلس، والإشراف على تنفيذها بعد اعتمادها.
- إصدار الأوامر بمصروفات المركز وفقًا للوائحه المالية.
- تعيين العاملين في المركز، والإشراف عليهم وفقاً لما تحدده اللوائح والتعليمات.
- التعاقد مع الخبراء والمستشارين من الداخل والخارج في حدود أغراض المركز، وفقًا لما تحدده اللوائح.
- تمثيل المركز أمام القضاء، ولدى الجهات الحكومية والمؤسسات والهيئات الأخرى ذات العلاقة، وغيرها من الجهات داخل المملكة وخارجها.
- التوقيع على الاتفاقات والعقود بعد موافقة المجلس.
- متابعة تنفيذ القرارات التي يصدرها المجلس.
- تقديم تقارير دورية إلى المجلس عن أعمال المركز، ومنجزاته، ونشاطاته.
- تقديم الاقتراحات إلى المجلس في شأن الموضوعات الداخلة في اختصاصه.
ولمدير المركز تفويض بعض صلاحياته ومهماته إلى غيره من مسؤولي المركز.